談到經濟適用房的問題,茅于軾認為,目前,全國都在推經濟適用房,但是經濟適用房既沒有平等,又沒有效益。之所以說沒有效益是因為經濟適用房不是資產分配,沒有物盡其用。“經濟適用房便宜是由于土地便宜,而便宜的土地是用低價從農民手中買入的。拿農民的土地蓋經濟適用房,這是一種不平等交換。有人認為經濟適用房好,因為誰的利益也不受損失,但是我認為現在其損害了農民的利益。”茅于軾說,“另外,如果家想買到便宜的經濟適用房,就會出現賄賂有權分配指標的人的現象,這就會滋生腐敗。在有的地方,為了防止出現這種情況,經濟適用房的分配通過抽簽來解決,但是這也不是一個好方法,因為參加抽簽要經過審核,誰又有權力來進行審核呢?并且,抽簽原則事實上是帶些賭博性質的分配原則,也是不合適的。
當有人表示,網上不少人士對其“經濟適用房應該停止”等觀點有所非議的時候,茅于軾半開玩笑地表示:“我知道網上有很多人罵我,我想罵我的人是因為他們可能會買到經濟適用房。”