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　　陰溝腸桿菌可以通過人體皮膚上口直接侵入感染人體或通過侵入性操作（留置導尿管、靜脈穿刺、機械通氣等）所產生的通道入侵機體導致感染。此外，機體免疫力低下或長期應用抗生素導致機體菌群失調也容易導致陰溝腸桿菌感染發病。內毒素是陰溝腸桿菌的致病因子。除此之外，該菌對消毒劑及抗生素有強烈的抵抗能力，如果應用病菌敏感性低的抗生素則可出現對抗生素敏感的菌株被抑制，耐藥菌株大量繁殖，容易造成醫院感染細菌的傳播和引起患者發病。這也是漸增多的醫院感染的重要因素。

　　陰溝腸桿菌對抗生素的耐藥性主要是產生產生ESBIs和AmpC酶，使抗生素藥物水解滅活，同時細菌體內青霉素作用靶位發生變性，導致藥物不能與之結合而喪失抗菌作用。由于第三代頭孢菌素的廣泛使用，容易篩選出高產AmpC酶的陰溝腸桿菌，導致耐藥菌廣泛傳播。所以在治療本病時應根據藥敏結果選擇合理的治療方案。