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　　(一)習慣命名法

　　1.一般采用底物加反應類型而命名，如蛋白水解酶、乳酸脫氫酶、磷酸己糖異構(gòu)酶等。

　　2.對水解酶類，只要底物名稱即可，如蔗糖酶、膽鹼酯酶、蛋白酶等。

　　3.有時在底物名稱前冠以酶的，如血清谷氨酸－丙酮酸轉(zhuǎn)氨酶、唾液淀粉酶等。

　　習慣命名法簡單，應用歷史長，但缺乏系統(tǒng)性，有時出現(xiàn)一酶數(shù)名或一名數(shù)酶的現(xiàn)象。

　　(二)系統(tǒng)命名法

　　鑒于新酶的不斷發(fā)展和過去文獻中對酶命名的混亂，國際酶學委員會規(guī)定了一套系統(tǒng)的命名法，使一種酶只有一種名稱。它包括酶的系統(tǒng)命名和4個數(shù)字分類的酶編號。例如對催化下列反應酶的命名。

　　ATP+D—葡萄糖→ADP+D—葡萄糖-6-磷酸

　　該酶的正式系統(tǒng)命名是：ATP：葡萄糖磷酸轉(zhuǎn)移酶，表示該酶催化從ATP中轉(zhuǎn)移一個磷酸到葡萄糖分子上的反應。它的分類數(shù)字是：E.C.2.7.1.1,E.C代表按國際酶學委員會規(guī)定的命名，第1個數(shù)字(2)代表酶的分類名稱(轉(zhuǎn)移酶類)，第2個數(shù)字(7)代表亞類(磷酸轉(zhuǎn)移酶類)，第3個數(shù)字(1)代表亞亞類(以羥基作為受體的磷酸轉(zhuǎn)移酶類)，第4個數(shù)字(1)代表該酶在亞-亞類中的排號(D葡萄糖作為磷酸基的受體)。